Sie sollten regelmäßig ein Backup der MySQL Datenbank durchführen.
Eine reine Sicherung auf Dateiebene, sollte immer durch einen SQL-Dump wie unter Informationen zum Backup ergänzt werden.
Wenn Sie manuell ein Backup erstellen möchten, können Sie auch die grafische Workbench nutzen. Im Bereich „Management“ oder „Administration“ finden Sie „Export/Import“.
Sehr detailierte Information von Oracle (MySQL) für Systemadministratoren:
Datensicherung und Wiederherstellung